Όσον αφορά την εφαρμογή, μπορεί απλά να χωριστεί σε δύο κατηγορίες, δηλαδή βιομηχανικά ενδοσκόπια και ιατρικά ενδοσκόπια.
Όσον αφορά τους τύπους βιομηχανικών ενδοσκοπίων, χωρίζονται σε οπτικά ενδοσκόπια, ενδοσκόπια οπτικών ινών, ηλεκτρονικά ενδοσκόπια, ενδοσκόπια βίντεο CCD, ενδοσκόπια βίντεο CMOS και ηλεκτρικά ενδοσκόπια 360° από τη μορφή απεικόνισης. Σύμφωνα με τον τύπο της πηγής φωτός ενδοσκοπίου, χωρίζεται σε ενδοσκόπιο λαμπτήρων φθορισμού υψηλής συχνότητας, ενδοσκόπιο λαμπτήρων αλογόνου οπτικών ινών και ενδοσκόπιο LED.
Όσον αφορά την ταξινόμηση των ιατρικών ενδοσκοπίων, ανάλογα με την ανάπτυξη και τη δομή απεικόνισης τους, μπορούν να χωριστούν χονδρικά σε τρεις κατηγορίες: άκαμπτα ενδοσκόπια σωλήνων, ενδοσκόπια οπτικών ινών (τύπου σωλήνα) και ηλεκτρονικά ενδοσκόπια.
Υπάρχουν πολλοί διαφορετικοί τύποι ενδοσκοπίων για ιατρική εξέταση και οι μέθοδοι ταξινόμησης τους είναι διαφορετικές. Σε γενικές γραμμές, οι ακόλουθες τρεις μέθοδοι ταξινόμησης είναι πιο συχνές. Όσον αφορά τις πωλήσεις στην αγορά, οι κατηγορίες που χρησιμοποιούνται περισσότερο χωρίζονται επί του παρόντος σε δύο τύπους: άκαμπτους καθρέφτες και εύκαμπτους εύκαμπτους καθρέφτες.
